MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021881	CAA	2	6	218059	218064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464224
4502	NC_021881	GAAA	2	8	218104	218111	75 %	0 %	25 %	0 %	526464224
4503	NC_021881	AGT	2	6	218134	218139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464224
4504	NC_021881	CTT	2	6	218170	218175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464224
4505	NC_021881	GCA	2	6	218227	218232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464224
4506	NC_021881	CTT	2	6	218346	218351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464224
4507	NC_021881	TAC	2	6	218373	218378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_021881	TAC	2	6	218389	218394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_021881	TA	3	6	218409	218414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021881	T	6	6	218428	218433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_021881	AATA	2	8	218442	218449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021881	TAT	2	6	218531	218536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021881	T	9	9	218541	218549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021881	TGT	2	6	218627	218632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021881	AT	3	6	218640	218645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_021881	TA	3	6	218655	218660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021881	TGC	2	6	218692	218697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_021881	ACCA	2	8	218702	218709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_021881	GTAT	2	8	218715	218722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021881	TTA	2	6	218737	218742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021881	CT	3	6	218765	218770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_021881	CAG	2	6	218820	218825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_021881	GCAC	2	8	218855	218862	25 %	0 %	25 %	50 %	526464800
4524	NC_021881	CAT	2	6	218918	218923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464800
4525	NC_021881	CAG	2	6	218938	218943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464800
4526	NC_021881	TCC	2	6	218973	218978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464800
4527	NC_021881	GAT	2	6	218986	218991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464800
4528	NC_021881	TCA	2	6	219049	219054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464800
4529	NC_021881	ACAT	2	8	219133	219140	50 %	25 %	0 %	25 %	526464800
4530	NC_021881	GAT	2	6	219154	219159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464800
4531	NC_021881	ATT	2	6	219187	219192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464800
4532	NC_021881	ACC	2	6	219247	219252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464800
4533	NC_021881	TAG	2	6	219320	219325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464800
4534	NC_021881	TAT	2	6	219383	219388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464800
4535	NC_021881	CT	3	6	219442	219447	0 %	50 %	0 %	50 %	526464800
4536	NC_021881	CA	3	6	219488	219493	50 %	0 %	0 %	50 %	526464800
4537	NC_021881	CGA	2	6	219510	219515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464800
4538	NC_021881	CGC	2	6	219516	219521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464800
4539	NC_021881	AGA	2	6	219626	219631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464225
4540	NC_021881	GCG	2	6	219723	219728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464225
4541	NC_021881	TA	4	8	219817	219824	50 %	50 %	0 %	0 %	526464225
4542	NC_021881	GA	3	6	219828	219833	50 %	0 %	50 %	0 %	526464225
4543	NC_021881	AAG	2	6	219939	219944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464225
4544	NC_021881	CAG	2	6	220006	220011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464225
4545	NC_021881	TAG	2	6	220090	220095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464225
4546	NC_021881	GTA	2	6	220098	220103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464225
4547	NC_021881	AG	3	6	220108	220113	50 %	0 %	50 %	0 %	526464225
4548	NC_021881	CTTT	2	8	220122	220129	0 %	75 %	0 %	25 %	526464225
4549	NC_021881	GAC	2	6	220173	220178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464225
4550	NC_021881	TC	3	6	220200	220205	0 %	50 %	0 %	50 %	526464225
4551	NC_021881	GGC	2	6	220239	220244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464225
4552	NC_021881	AGG	2	6	220286	220291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464225
4553	NC_021881	GGCA	2	8	220340	220347	25 %	0 %	50 %	25 %	526464225
4554	NC_021881	TTA	2	6	220516	220521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464225
4555	NC_021881	GTC	2	6	220609	220614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_021881	ATGC	2	8	220790	220797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_021881	TTGCG	2	10	220800	220809	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4558	NC_021881	CTA	2	6	220847	220852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_021881	AGT	2	6	220860	220865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_021881	GTG	2	6	220910	220915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021881	TGTGA	2	10	220928	220937	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021881	TG	3	6	220965	220970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021881	CTTT	2	8	221001	221008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_021881	TGAT	2	8	221027	221034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021881	GGAA	2	8	221035	221042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021881	GT	3	6	221052	221057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_021881	ACAGAA	2	12	221229	221240	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4568	NC_021881	TTC	2	6	221351	221356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
4569	NC_021881	TGC	2	6	221358	221363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464226
4570	NC_021881	TTC	2	6	221463	221468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
4571	NC_021881	CCT	2	6	221492	221497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464226
4572	NC_021881	TTTTC	2	10	221636	221645	0 %	80 %	0 %	20 %	526464226
4573	NC_021881	GCAATG	2	12	221656	221667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526464226
4574	NC_021881	GCAT	2	8	221725	221732	25 %	25 %	25 %	25 %	526464226
4575	NC_021881	T	8	8	221739	221746	0 %	100 %	0 %	0 %	526464226
4576	NC_021881	ATC	2	6	221901	221906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
4577	NC_021881	ATC	2	6	221908	221913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
4578	NC_021881	TATG	2	8	221919	221926	25 %	50 %	25 %	0 %	526464226
4579	NC_021881	AAAG	2	8	221968	221975	75 %	0 %	25 %	0 %	526464226
4580	NC_021881	CTT	2	6	222014	222019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
4581	NC_021881	AGA	2	6	222053	222058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464226
4582	NC_021881	T	7	7	222068	222074	0 %	100 %	0 %	0 %	526464226
4583	NC_021881	CTC	2	6	222172	222177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464226
4584	NC_021881	AAG	2	6	222206	222211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464226
4585	NC_021881	AGTT	2	8	222236	222243	25 %	50 %	25 %	0 %	526464226
4586	NC_021881	TCT	2	6	222307	222312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
4587	NC_021881	AG	3	6	222347	222352	50 %	0 %	50 %	0 %	526464226
4588	NC_021881	T	6	6	222404	222409	0 %	100 %	0 %	0 %	526464226
4589	NC_021881	GGA	2	6	222544	222549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464226
4590	NC_021881	CCTG	2	8	222630	222637	0 %	25 %	25 %	50 %	526464226
4591	NC_021881	AAG	2	6	222676	222681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464226
4592	NC_021881	GAG	2	6	222742	222747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464226
4593	NC_021881	TTC	2	6	222759	222764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
4594	NC_021881	ACT	2	6	222787	222792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
4595	NC_021881	TAG	2	6	222842	222847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464226
4596	NC_021881	ACT	3	9	222985	222993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
4597	NC_021881	ACC	2	6	223005	223010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464226
4598	NC_021881	TC	3	6	223031	223036	0 %	50 %	0 %	50 %	526464226
4599	NC_021881	GCA	2	6	223087	223092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464226
4600	NC_021881	TCC	2	6	223119	223124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464226
4601	NC_021881	CAA	2	6	223127	223132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464226
4602	NC_021881	CTA	2	6	223133	223138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
4603	NC_021881	CAT	2	6	223139	223144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
4604	NC_021881	TTA	2	6	223167	223172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021881	ATG	2	6	223220	223225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_021881	TTA	2	6	223241	223246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464227
4607	NC_021881	TAT	2	6	223269	223274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464227
4608	NC_021881	AGG	2	6	223320	223325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464227
4609	NC_021881	GGTA	2	8	223328	223335	25 %	25 %	50 %	0 %	526464227
4610	NC_021881	AGC	2	6	223395	223400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464227
4611	NC_021881	AGG	2	6	223429	223434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464227
4612	NC_021881	TGA	2	6	223447	223452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464227
4613	NC_021881	ATGCGT	2	12	223467	223478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526464227
4614	NC_021881	TAC	2	6	223566	223571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464227
4615	NC_021881	TGT	2	6	223578	223583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464227
4616	NC_021881	AAC	2	6	223655	223660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464227
4617	NC_021881	GCT	2	6	223727	223732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464227
4618	NC_021881	GCGTT	2	10	223772	223781	0 %	40 %	40 %	20 %	526464227
4619	NC_021881	TGC	2	6	223852	223857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464227
4620	NC_021881	TGA	3	9	223884	223892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464227
4621	NC_021881	TG	3	6	224099	224104	0 %	50 %	50 %	0 %	526464801
4622	NC_021881	AAGA	2	8	224153	224160	75 %	0 %	25 %	0 %	526464801
4623	NC_021881	TAC	2	6	224210	224215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_021881	AGC	2	6	224257	224262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464802
4625	NC_021881	GCAG	2	8	224269	224276	25 %	0 %	50 %	25 %	526464802
4626	NC_021881	ATC	2	6	224277	224282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464802
4627	NC_021881	CAA	2	6	224297	224302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464802
4628	NC_021881	AAGC	2	8	224373	224380	50 %	0 %	25 %	25 %	526464802
4629	NC_021881	GTTT	2	8	224557	224564	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_021881	CAA	2	6	224648	224653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_021881	ACC	2	6	224667	224672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_021881	ACGC	2	8	224680	224687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_021881	AAC	2	6	224694	224699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_021881	CAA	2	6	225156	225161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_021881	CTAG	2	8	225274	225281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4636	NC_021881	GTG	2	6	225347	225352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_021881	AT	3	6	225419	225424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_021881	ATTCT	2	10	225456	225465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4639	NC_021881	GTAA	2	8	225530	225537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_021881	CAT	2	6	225596	225601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464803
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4658	NC_021881	TAG	2	6	226169	226174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4683	NC_021881	AT	3	6	227299	227304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4684	NC_021881	GCC	2	6	227307	227312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4998	NC_021881	A	6	6	241855	241860	100 %	0 %	0 %	0 %	526464235
4999	NC_021881	TGC	2	6	241862	241867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464235
5000	NC_021881	GGTG	2	8	241888	241895	0 %	25 %	75 %	0 %	526464235

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